Анатомията на Грей Сезон 2 започва веднага след като Адисън се появява и се представя на Мередит като съпругата на Дерек. По-късно пациент открива, че Мередит е спала със съпруга на Адисън и тя е груба с Мередит. Адисън се намесва и казва, че тя е изневерила на съпруга си и пациентът дължи на Мередит извинение. Дерек разказва историята на Мередит. Дерек и Адисън живееха там Ню Йорк и той се прибра вкъщи, за да намери Адисън в леглото с най-добрия си приятел Марк. Той си беше тръгнал и дойде на себе си Сиатъл.
Проблеми с МакДрийми на Мередит
Адисън дойде в Сиатъл, за да накара Дерек да се върне в Ню Йорк с нея. Той точно не се възползва от шанса и тя му дава документи за развод, в които казва, че ще подпише, ако го направи. Тя казва на Мередит, че не иска мъж, който не я иска, но ако има и най-малката възможност да го направи, тя няма да напусне Сиатъл.
Първо Мередит казва, че не иска да има нищо общо с него, но след това променя решението си и казва, че иска той да я избере и да я обича. Тя казва да подпише
Дерек се опитва да извлече най-доброто от нещата с Адисън. Отношенията им са обтегнати и Дерек очевидно обича да е около Мередит, но той се опитва да уреди нещата с Адисън. Той казва на Адисън, че Мередит не е блудница, той се е влюбил в нея и тези чувства не изчезват веднага.
След известно време мразя Дерек, Мередит решава, че могат да бъдат приятели. Сутрин разхождат кучето, което Мередит взе от лирата, но не можа да задържи и даде на Дерек.
Дерек е изключително разстроен, когато научава, че Мередит излиза с ветеринаря на кучето. Той я нарича курва, а тя казва, че Дерек не може да я нарече курва, защото я е счупил. Адисън засилва напрежението помежду им и получава срив, който чува половината болница.
Мередит се чувства клаустрофобична, когато види Дерек да я наблюдава. Тя бяга, а той го следва и накрая спят заедно. Когато дойде време за тръгване, Мередит е между ветеринаря и Дерек и двамата я молят да дойде с тях. Тя гледа едното, след това другото и пак обратно.
Бебето и татко
Кристина казва на Мередит, че е бременна, но не й казва кой е бащата. Мередит разбира това, когато Джордж казва, че е видял Кристина да целува Бърк. Кристина припада по време на операция и е откарана на операция за извънматочна бременност. Няколко дни по-късно Бърк и Кристина отново се събират. В крайна сметка той иска да знае какви са били плановете й за бебето и тя е изненадана, че той не се ядосва, когато тя казва, че не е планирала да има бебе.
Бърк е прострелян и губи контрол над ръката си, а Кристина трудно е до него, но накрая се присъединява към него в болничната стая и го държи за ръката.
Сериозно? Джордж?
Джордж се опитва да каже на Мередит какво чувства към нея, но тя наистина не слуша, докато една нощ е особено уязвима. Те спят заедно, но Мередит получава пристъп на плач по средата на правенето на любов и Джордж изтича и след това се изнася. Тя се опитва да се извини, но той няма да има нищо общо с нея. След няколко месеца той й прощава, казвайки, че е знаел, че не е наред, дори докато се е случвало, и е трябвало да го спре.
Джордж започва да се среща с д-р Кали Торес, неуверена жена, която е страхотен ортопедичен хирург. Тя иска да се вписва в приятелите на Джордж, но изглежда е отвън.
Изи и слабото сърце
Изи се влюбва в един от сърдечните пациенти на Бърк, докато тя се среща с Алекс. Алекс казва на пациента, Дени, да се отдръпне, защото ще умре и тогава Изи ще бъде съсипана. Изи разбира какво е направил Алекс и се разделя с него. За да накара Дени да се издигне в списъка на донорите, за да получи сърцето, от което се нуждае, Изи прекъсва един от кабелите си, мислейки, че Бърк ще се върне с новото сърце всеки момент и ще може да поправи Дени. Бърк не идва, защото е бил застрелян, а Изи, Мередит, Джордж и Кристина се опитват отчаяно да спасят Дени, но не знаят какво да правят.
Алекс уговаря кардиоторакалния хирург Ерика Хан да дойде в болницата, за да направи операцията и тя в крайна сметка спасява Дени. Дени моли Изи да се омъжи за него и тя приема. Дени изглежда напълно добре, но след това внезапно умира и Изи е съсипана.
Стресово раждане
Д-р Бейли казва на Уебър, че е бременна, а няколко месеца по-късно Адисън поставя Бейли на почивка в леглото. Бейли идва в болницата при раждане. Съпругът й, бързайки да стигне до болницата, катастрофира с колата си и Дерек му прави мозъчна операция. Той се справя и Бейли, с много помощта на Джордж, има момченце.
Входът на McSteamy
Марк Слоун се появява в болницата и флиртува с Мередит. Дерек го удря и докато Мередит държи огледалото, за да може Марк да зашие собственото си лице (той е пластичен хирург), той посочва че когато Дерек го хвана в леглото с Адисън, той се обърна и си отиде, но когато просто говореше с Мередит, Дерек удари него.
