Семейство Прадо и Скинър заемат централно място за сезон 3 на Декстър. Плюс това, Декстър става семеен човек.
Личният живот на Декстър
Рита открива, че е бременна и те решават да се оженят. Докато Рита напредва със сватбените си планове, Декстър много го няма с новия си приятел Мануел Прадо. Мануел вижда Декстър такъв, какъвто всъщност е и не е отблъснат. Декстър започва да губи бдителността си с Мануел и те стават истински приятели.
В момента, когато едва не умира от ръцете на Джордж Кинг, Декстър осъзнава, че наистина иска да види сина си да се появи на бял свят и иска да го види как расте.
Декстър моли Дебра да му бъде кум и двамата с Рита се женят.
Кодът на Хари
Декстър открива, че сексуален хищник наблюдава Астор. Според кода на Хари, Декстър не може да убие хищника, защото той не е убиец. Декстър заключава, че кодът трябва да се развие и да стане негов. Той убива хищника.
Семейство Прадо
Декстър намира следващото си убийство, дилър на наркотици-убиец, който носи името Фрибо. Декстър случайно се препъва в битка между Фрибо и човек, за когото по-късно разбира, че е Оскар Прадо. Фрибо бяга и Декстър убива Оскар при самозащита. По случая работи братът на Оскар, помощник-окръжният прокурор Мигел Прадо. Мигел има история с LaGuerta и те все още са близки.
Декстър намира Фрибо и го убива, но Мигел почти го хваща. Отвън Декстър казва на Мигел, че е трябвало да убие Фрибо при самозащита. Мигел му помага да прикрие престъплението и двамата започват да излизат заедно. Рита обича да прекарва време със съпругата на Мигел, Сил.
Мигел събира две и две, когато престъпник, от когото се оплакваше, се оказва мъртъв. Той иска да работи с Декстър, за да направи града по-безопасно място. Декстър иска да го обезкуражи и затова измисля план Мигел да пусне престъпник, за да може Декстър да го убие. Той е шокиран, когато Мигел изпълнява плана.
Мигел иска да убият твърда адвокатка Елън Улф, която пречи на Мигел професионално. Декстър казва, че не отговаря на кода и когато тя се оказва изчезнала, Декстър подозира Мигел и потвърждава подозренията му, като следва уликите, оставени от Мигел.
Декстър се опитва да се възползва от Мигел, но накрая стига до заключението, че ще трябва да го убие. Мигел наема ядосания си брат Рамон като бодигард. Планът на Декстър е да го направи в нощта на сватбата, защото Мигел трябваше да бъде негов кум. Декстър забелязва, че ЛаГуерта е на Мигел и че е в опасност, така че Декстър го убива по-рано.
Юки Амадо
Юки, агент по вътрешните работи, се свързва с Дебра, защото иска информация за новия партньор на Дебра, Джоуи Куин. Дебра отказва много, много искания от Юки и в крайна сметка казва на Куин, че е разследван. Куин казва, че това е лично, но по-късно казва на Дебра, че Юки е бил негов партньор и тя никога не му е простила за знаейки за пристрастеността на колега към наркотиците и се опитваше да му помогне лично, вместо да отиде при тях началници. Мъжът е починал от свръхдоза наркотици.
Скинърът
Когато Декстър за първи път разпознава жертва като Тийгън, приятелката на Фрибо, той предполага, че Фрибо я е убил. Но когато убийствата продължават, след като Декстър убива Фрибо, той знае, че това е някой друг, въпреки че полицейското управление търси Фрибо. Убиецът се нарича Скинър, защото премахва кожата на жертвата си, преди да я убие. В крайна сметка отделът свързва Джордж Кинг с убийствата и Декстър разбира, че одира хората като мъчение, защото иска да му кажат как да намери Фрибо, който му дължи пари.
Скинър отвлича Декстър и го връзва за маса. Декстър се освобождава и убива Скинър точно когато пристига полицията. Декстър го хвърля върху полицейска кола, за да изглежда като самоубийство, и след това се измъква през прозореца.
Човекът на Дебра
Докато търси Скинър, Куин казва на Дебра да говори с неговия поверителен информатор Антон Бригс. Дебра говори с него няколко пъти и те създават романтична връзка. Дебра се чувства виновна, че има връзка с CI и казва на Декстър, че баща им не би одобрил. Декстър казва на Дебра, че баща им е имал връзка с CI.
Сержант Батиста препоръчва Дебра за детективски щит и ЛаГуерта я пита дали предпочита да има щита или Антон и тя избира Антон. ЛаГуерта казва, че личният й живот винаги трябва да е на първо място и й дава щита.
Антон е хванат от Скинър и Дебра работи извънредно, докато не намери Антон.
Връзката на Декстър
Декстър, който твърди, че няма чувства, винаги търси връзка. Той си помисли, че е открил тази връзка в Мигел Прадо и започна да споделя най-дълбоките си тайни, само за да разбере, че Мигел го манипулира. Търсенето на връзка на Декстър продължава.
