Chirurgové sezóna 2 začíná hned poté, co se objeví Addison a představí se Meredith jako Derekova manželka. Později pacient zjistí, že Meredith spala s Addisonovým manželem a je na Meredith hrubá. Addison zasáhne a řekne, že to byla ona, kdo podváděl svého manžela, a pacient dluží Meredith omluvu. Derek vypráví Meredith příběh. Derek a Addison bydleli v New York a přišel domů, aby našel Addison v posteli se svým nejlepším přítelem Markem. Odešel a přišel Seattle.
Meredith's McDreamy Issues
Addison přijela do Seattlu, aby Dereka přemluvila, aby se s ní vrátil do New Yorku. Neskočí po šanci a ona mu dá rozvodové papíry s tím, že pokud to udělá, podepíše. Řekne Meredith, že nechce muže, který ji nechce, ale pokud existuje sebemenší šance, že chce, ona Seattle neopustí.
Nejprve Meredith řekne, že s ním nechce mít nic společného, ale pak změní názor a řekne, že chce, aby si ji vybral a miloval ji. Říká, abyste podepsali rozvod papíry a setkáme se s ní v Joeově baru. Čeká, ale on se ukáže až poté, co odejde.
Derek se z Addison snaží vytěžit to nejlepší. Jejich vztah je napjatý a Derek je zjevně rád v Meredith, ale snaží se to vyřešit s Addison. Řekne Addison, že Meredith nebyla úlet, zamiloval se do ní a tyto pocity jen tak okamžitě nezmizí.
Po nějaké době, kdy nenáviděla Dereka, se Meredith rozhodla, že by mohli být přátelé. Ráno venčí psa, kterého Meredith dostala z libry, ale nemohla si ho nechat a dala Derekovi.
Derek je extrémně rozrušený, když se dozví, že Meredith chodí s psím veterinářem. Říká jí děvka a ona říká, že Derek jí nemůže říkat děvka, protože ji zlomil. Addison zaznamená napětí mezi nimi a dojde ke zhroucení, které slyší polovina nemocnice.
Meredith se cítí klaustrofobicky, když vidí, jak ji Derek sleduje. Ona uteče a on ji následuje a nakonec spolu spí. Když je čas odejít, Meredith je mezi veterinářem a Derekem a oba ji žádají, aby šla s nimi. Podívá se na jednu, pak na druhou a zase zpátky.
Dítě a tatínek
Cristina řekne Meredith, že je těhotná, ale neřekne jí, kdo je otec. Meredith na to přijde, když George říká, že viděl Cristinu líbat Burkeho. Cristina během operace omdlí a je uspěchaná na operaci kvůli mimoděložnímu těhotenství. O několik dní později se Burke a Cristina dají znovu dohromady. Nakonec chce vědět, jaké byly její plány s dítětem, a ona je překvapená, že se nezlobí, když říká, že dítě neplánovala.
Burke je postřelen a ztrácí kontrolu nad rukou a Cristina má pro něj těžké chvíle, ale nakonec se k němu připojí v jeho nemocničním pokoji a drží ho za ruku.
Vážně? Jiří?
George se snaží Meredith říct, co k ní cítí, ale ona ve skutečnosti neposlouchá, až do jedné noci, kdy je obzvláště zranitelná. Spí spolu, ale Meredith má uprostřed milování záchvat pláče a George vyběhne a pak se odstěhuje. Pokusí se omluvit, ale on s ní nebude mít nic společného. Po několika měsících jí odpustí a řekl, že věděl, že je to špatně, i když se to stalo, a měl to zastavit.
George začne chodit s doktorkou Callie Torresovou, nejistou ženou, která je skvělá ortopedická chirurgička. Chce zapadnout mezi Georgeovy přátele, ale zdá se, že je navenek.
Izzie a slabé srdce
Izzie Zamiluje se do jednoho z Burkeových srdečních pacientů, zatímco ona chodí s Alexem. Alex říká pacientovi Dennymu, aby se odtáhl, protože zemře, a pak bude Izzie zdrcena. Izzie zjistí, co Alex udělal, a rozejde se s ním. Aby se Denny posunul na seznam dárců, aby získal srdce, které potřebuje, Izzie přestřihne jeden z jeho drátů a myslí si, že Burke bude každou chvíli zpět s novým srdcem a bude moci Dennyho opravit. Burke nepřichází, protože byl zastřelen a Izzie, Meredith, George a Cristina se zoufale snaží zachránit Dennyho, ale nevědí, co dělat.
Alex přemluví kardiochirurga Ericu Hahnovou, aby přijela do nemocnice na operaci, a nakonec zachrání Dennyho. Denny požádá Izzie, aby si ho vzala a ona souhlasí. Denny se zdá být naprosto v pořádku, ale pak najednou zemře a Izzie je zdrcená.
Stresující porod
Dr. Bailey řekne Webberovi, že je těhotná, a o několik měsíců později Addison uloží Bailey na lůžko. Bailey přichází do nemocnice při porodu. Její manžel, který spěchá do nemocnice, nabourá auto a Derek mu podstoupí operaci mozku. Vydrží to a Bailey, se spoustou pomoci od George, má chlapečka.
McSteamy's Entrance
Mark Sloan se objeví v nemocnici a flirtuje s Meredith. Derek ho praští pěstí, a zatímco Meredith drží zrcadlo, aby si Mark mohl sešít vlastní obličej (je plastický chirurg), ukáže že když ho Derek přistihl v posteli s Addison, otočil se a odešel, ale když jen mluvil s Meredith, Derek praštil mu.