Perintah 66 adalah perintah yang diberikan Kanselir Palpatine kepada Tentara Besar Republik di Episode III: Balas Dendam Sith. Itu adalah salah satu dari beberapa perintah darurat yang diberikan kepada Pasukan Klon, yang dilatih untuk mereka ikuti tanpa pertanyaan jika terjadi keadaan darurat. Order 66, yang hanya bisa dieksekusi atas perintah langsung Palpatine, meminta Pasukan Klon untuk membunuh pemimpin Jedi mereka. Seolah-olah untuk mencegah Jedi berbalik melawan Republik, Order 66 benar-benar merupakan rencana Palpatine untuk melenyapkan Jedi Order. Sith bisa mengambil alih kekuasaan.
Di Alam Semesta: Urutan 66 menyatakan:
Dalam hal perwira Jedi bertindak melawan kepentingan Republik, dan setelah menerima perintah khusus yang diverifikasi sebagai datang langsung dari Panglima Tertinggi (Kanselir), para komandan GAR akan memberhentikan perwira-perwira itu dengan kekuatan mematikan, dan komando GAR akan kembali ke Panglima Tertinggi (Rektor) sampai struktur komando baru terbentuk. didirikan.
Ketika Order 66 diterbitkan, sejumlah Pasukan Klon percaya itu sebagai perintah palsu dan mulai melindungi Jedi bukannya membunuh mereka. Beberapa Jedi lainnya selamat dengan membunuh Clone Troopers yang menyerang.
Darth Vader memimpin kampanye untuk memburu dan membunuh sebagian besar yang selamat di tahun-tahun setelah Orde 66. Penghancuran Jedi Kekaisaran ini dikenal sebagai Pembersihan Jedi Besar. Lebih dari 100 Jedi dan mantan Jedi bersembunyi dan selamat dari seluruh Pembersihan; misalnya, Yoda dan Obi-Wan Kenobi selamat dengan pergi ke pengasingan di planet terpencil Dagobah dan Tatooine.