Chirurgové sezóna 6 začalo třeskem a skončilo mnoha rány! Po několika nevýrazných tématech a epizodách v minulých sezónách se sezóna 6 vrací, aby vykoupila show jako celek tím, že s každou epizodou poskytuje poutavé a akční drama.
Sloučením s jinou nemocnicí a novými skupinami lékařů se děj začíná nabírat novými zvraty:
Georgeova smrt
Všichni jsou zdrceni Georgeovou smrtí, i když ji většina blokuje, ale v té či oné chvíli každý pláče pro svou ztrátu.
Játra pro Thatcherovou
Thatcherová potřebuje nová játra a Lexie se okamžitě nechá testovat. Nehodí se a žádá Meredith, aby testovala. Zpočátku se zdráhá, ale pak testuje a zjistí, že se hodí. Po operaci leží na chvíli v posteli.
Sloučení s Mercy West
Náčelník oznamuje, že se Seattle Grace spojí s Mercy West. Reed, April, Percy a Avery jsou někteří z obyvatel, kteří pocházejí z Mercy West. Zpočátku se k sobě nehodí, ale nakonec to jde hladce, i když je u ordinací velká konkurence.
Izzie odchází
Izzie zmizí a Alex neví, jestli pokračuje v léčbě. Opakovaně se jí pokouší dovolat, ale ona se mu neozývá. Když se vrátí a zjistí, že je bez rakoviny, chce se s ním dát znovu dohromady, ale on říká, že si zaslouží něco lepšího. Začne chodit s Lexi, ale když si myslí, že umírá, zavolá Izzie.
Owen dává Cristině Teddyho
Owen dostane Teddyho Altmana, kardiotorakálního chirurga, který byl ve válce s Owenem, aby přišel do nemocnice. Cristina ji miluje, ale problém je, že i Owen. Owen miluje Cristinu a Teddyho a Teddy ho nakonec přiměje vybrat si a on si vybere Cristinu.
Bailey Dates
Bailey začíná chodit s anesteziologem Benem Warrenem a je mnohem šťastnější, dokud ho neuvidí flirtovat s kolegou z práce. Řekne jí, že je to falešné flirtování a že to dělá proto, aby na něj byla milá, když plánuje, ale že mu na Bailey opravdu záleží a to je opravdu flirtování.
Derek je šéf
Meredith si uvědomí, že náčelník pije, ale kryje ho. Zmíní se o tom Derekovi a požádá ho, aby to nikomu neříkal. Chvíli se zdrží, ale pak to řekne tabuli. Pošlou Webbera do rehabilitačního zařízení a udělají z Dereka šéfa. Derek nesnáší být šéfem, protože nemá čas na operace. Když se Webber vrátí, správní rada mu nedovolí pokračovat v práci hned, takže pracuje pod Derekem jako ošetřovatel.
Žádná miminka
Arizona a Callie se rozejdou, protože Callie chce děti a Arizona ne. Po vyděšení ze smrti Callie říká, že může žít bez dětí, ale nemůže žít bez Arizony. Arizona říká, že chce hodně dětí.
Markova dcera ho najde a řekne mu, že je těhotná. Pozve ji, aby s ním bydlela, a tak Lexie odejde. Když se dítě narodí, Mark si ho chce nechat, ale Arizona mu to přemluví s tím, že dítě má hodné rodiče, kteří na něj čekají.
Meredith zjistí, že je těhotná, ale později toho dne dojde k přestřelce a ona potratí dříve, než bude mít příležitost to říct Derekovi.
Shoot Out
Gary Clark přivedl svou ženu Allison do nemocnice, ale nedokázali ji zachránit. Byla pacientkou Webbera a Lexie a proti Garyho vůli vypnuli stroj, který ji držel při životě, kvůli pokročilé směrnici, kterou podepsala před třemi lety.
O několik týdnů později, po soudním sporu, přichází Gary do nemocnice a ptá se Reeda, kde je šéf, a ona ho vyhodí, takže ji zastřelí. Alex se přijde podívat, co se stalo, a zastřelí ho. Alex se vleče k výtahu.
April zakopne o Reeda, když se prochází a píše si do deníku. Je v šoku, ale podaří se jí říct Derekovi, že Reed je mrtvý. Derek zavolá ochranku a policii a dostane pokyn zamknout nemocnici.
Gary zastřelí Percyho, ale ne Baileyovou, protože říká, že je zdravotní sestra. Když Gary odejde, snaží se zachránit Percyho s pomocí svého pacienta. Táhnou ho k výtahu, ale výtahy nejedou, protože jsou v uzamčení a Percy umírá.
Gary zastřelí ošetřovatelku a pak Mark a Lexie najdou Alexe a pokusí se mu pomoci.
Gary najde Dereka a zatímco Meredith a Cristina sledují, Gary na Dereka nasměruje svou zbraň. Derek ho přemluví, ale vstoupí April a Gary Dereka zastřelí.
Cristina se snaží zabránit Meredith, aby nešla za Derekem, ale udělá to poté, co Gary odešel. Dostanou ho na operační sál a Cristina operuje.
Gary najde Lexie a řekne, že je tam, aby zastřelil Dereka, Webbera a ji, protože právě oni nechali jeho ženu zemřít. Gary je střelen do ramene odstřelovačem.
Owen a Teddy to zvládnou, ale Owen se vrátí za Cristinou. Webber, který nebyl v nemocnici, proklouzne kolem policie a dostane se dovnitř.
Owen najde Cristinu, která operuje Dereka s pistolí u hlavy. Gary chce, aby přestala. Owen vytvoří rozptýlení a je zastřelen. Avery odpojí srdeční monitor a Gary si myslí, že Derek je mrtvý, a jakmile odejde, začnou ho znovu operovat. Cristina říká Meredith, aby vzala Owena vedle a vytáhla z něj kulku. April si všimne, že Meredith krvácí a Meredith říká, že má a potrat.
Webber najde Garyho a Gary říká, že mu zbývá jen jedna kulka, takže nemůže zastřelit Webbera a pak sebe, jak plánoval. Webber říká, že může zastřelit Webbera a pak jít do vězení, nebo se zastřelit a jít se svou ženou do posmrtného života. Zastřelí se.
